酵母双杂交研究蛋白质相互作用的原理-8846威尼斯
信息来源:金开瑞 作者:genecreate 发布时间:2023-09-27 16:38:48
酵母双杂交(y2h)是常用的蛋白质相互作用研究方法,其原理基于酵母细胞中的转录活性分子的相互作用。
y2h实验基于以下三个主要组件:
靶蛋白(prey protein):需要研究的蛋白质,它与其他蛋白质进行相互作用。
激活域(activation domain,ad):通常以融合蛋白的形式存在,该融合蛋白同时携带靶蛋白和ad。
dna结合域(dna-binding domain,bd):也以融合蛋白的形式存在,它能够结合到启动子区域上,从而促进报告基因的表达。
实验步骤如下:
构建ad和bd融合蛋白质:将靶蛋白与ad载体或bd载体进行融合,得到ad-靶蛋白和bd-靶蛋白两种融合蛋白质。
转化酵母菌:将ad-靶蛋白和bd-靶蛋白构建的质粒分别转化到酵母菌中。
检测蛋白质相互作用:将ad-靶蛋白和bd-靶蛋白转化后的酵母菌培养在选择性培养基上,其中只有当两种融合蛋白发生相互作用时,相应的启动子区域才能被bd结合域激活,从而触发报告基因的表达。
鉴定相互作用:选择性培养基筛选出能够产生报告基因表达的克隆,然后通过进一步验证,如重远程pcr、酵母细胞存活测试等,确认蛋白质之间的相互作用。
y2h方法的优点包括对于蛋白质与蛋白质之间的直接相互作用的检测、高通量筛选的可行性以及实验操作简单。但也存在一些限制,例如无法模拟细胞内复杂环境下的蛋白质相互作用,以及可能出现假阳性或假阴性结果的问题。因此,在进行y2h实验时,需要结合其他实验方法和验证手段,综合分析数据,确保结果的可靠性。
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