rip实验原理与实验步骤-8846威尼斯

信息来源:金开瑞 作者:genecreate 发布时间:2023-10-16 17:00:34

    rip研究rna与蛋白质相互作用的实验技术,常用于确定特定rna分子与特定蛋白质的结合关系以及相关的功能。

    rip实验基于免疫共沉淀的原理,通过特定抗体与目标蛋白质结合,然后沉淀出与该蛋白质结合的rna分子。主要包括以下步骤:

    细胞或组织的交联:通过将细胞或组织进行交联,可以固定rna与其交互作用的蛋白质,防止在后续处理过程中的非特异性结合和降解。

    细胞或组织的裂解:将交联后的细胞或组织裂解,使得rna与蛋白质释放到溶液中。

    免疫共沉淀:将特异性抗体与目标蛋白质结合,形成抗体-蛋白质复合物。然后将这些复合物与免疫沉淀剂(如蛋白a/g磁珠)结合,让复合物与磁珠发生特异性结合。

    洗涤:通过多次洗涤去除非特异性结合的蛋白质和rna。

    rna的提取:将沉淀下来的复合物进行裂解,并提取出与蛋白质结合的rna。

    rna的分析:提取的rna可以通过多种方法进一步进行分析,例如逆转录-聚合酶链反应(rt-pcr)、实时定量pcr、rna测序等。

    在rip实验中,还需要设置相应的对照组,如以未免疫或使用非特异性抗体作为对照。这样可以帮助区分真正的特异性结合和背景非特异性结合。

    rip实验包括细胞的交联、裂解、免疫共沉淀、洗涤、rna提取和rna分析等步骤,通过这些步骤可以富集与目标蛋白质特异性结合的rna分子,并进一步研究其功能和相互作用。




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