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这是由于label free 的定量原理决定的，label－free为非同位素标记技术，样品内没有同位素标签，每个样本单独酶解后，依次独立进行色谱分离和质谱分析，后续通过比较不同样本中相应肽段的信号强度，来对肽段对应的蛋白质进行相对定量，所以无论任何样本类型，只要是同一蛋白或基因，都可以比较。