高通量基因组
测序或能为罹患皮肤t细胞淋巴瘤（ctcl）患者的诊断提供一种有价值的工具；ctcl是一种很难检测的血癌，它常被误做湿疹或皮炎等良性的皮肤病。这种方法还就该病的生物学提供了新的见解，它能准确地诊断ctcl患者（包括疾病早期和复发者），并证明比目前标准临床试验的敏感性和特异性更高。在 ctcl患者中，癌性t细胞在皮肤中累积，它不但引起皮肤肿瘤，也会引起皮疹，后者常被错误地看做是良性的皮肤炎性疾病，使其在临床上的诊断平均被延误6年。在皮肤病灶中的健康t细胞数量远远超过恶性t细胞的数量，使得用标准临床试验来检测ctcl颇具挑战性。在寻找新的诊断方法的过程中，ilan kirsch和同事用高通量测序（hts）来分析46名ctcl患者的血液和皮肤组织样本中的t细胞受体基因，并将其与健康人和牛皮癣、湿疹及其它非癌性炎症性皮肤病的皮肤样本进行比较。通过识别及量化恶性t细胞，该技术在所有46名患者中准确地将ctcl与其它皮肤病区分开来。相反，聚合酶链反应（这是最常用的ctcl诊断测试方法）只能正确地诊断70%的癌性样本，且常常错失对早期癌症的诊断。研究人员在一个病人的亚组中用hts来追踪恶性t细胞随时间的变化，使其能检测到该病的早期复发并能对病人的治疗反应进行监控。t细胞受体测序还揭示了对ctcl细胞起源（一直仍未弄清）的新的了解。研究人员发现，该癌症源自成熟的t细胞而非不成熟的t细胞，这或能指导设计更有效的疗法。总之，这些发现提示，hts为指导早期诊断及ctcl患者的治疗提供了一种有前途的工具。由 jason weed 和 michael girardi 撰写的相关《焦点》对将hts推进成为一个临床诊断工具的前景和挑战进行了讨论。
